【快播報】中國水產科學研究院淡水中心在淡水螺類遺傳與苗種繁育研究方面取得新進展

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近日，中國水產科學研究院創新團隊、淡水漁業研究中心“長江特色水生動物繁養創新團隊”在淡水螺類遺傳與苗種繁育研究方面取得新進展。

梨形環棱螺（B. purificata）俗稱螺螄、石螺、豆田螺、湖螺，是環棱螺屬中個體最大的種，具有分布廣、用途多的優點，既是中華絨螯蟹、中華鱉、青魚等優質水產品的重要天然餌料，也是特色水產品寬體金線蛭的唯一餌料來源，更是廣大市民“菜籃子”工程的重要組成部分之一。作為柳州螺螄粉重要原料之一，梨形環棱螺的短缺一定程度上也限制了地方特色產業的快速發展。此外，在淡水水域生態系統中，梨形環棱螺對維持淡水水生態系統平衡同樣具有不可替代的作用。

自2015年起，團隊圍繞梨形環棱螺群體遺傳學、選擇育種、池塘一級凈化區不投餌養殖和“稻螺共作”等生產方式及水產品加工領域開展了系列研究，為梨形環棱螺規?；别B積累了一系列解決方案。

為了進一步挖掘梨形環棱螺種質資源，團隊通過PacBio測序和Hi-C技術組裝獲得了首個梨形環棱螺染色體水平基因組，共產生了33.64Gb的環形一致性序列。初步組裝的梨形環棱螺基因組大小為1.01Gb，Contig N50長45.14Mb。通過Hi-C技術的糾錯，最終得到984.33Mb大小的梨形環棱螺基因組，Contig N50長37.21Mb，scaffold N50長141.97 Mb，并將99.28%的基因組序列錨定到8條染色體上，共預測了22125個蛋白編碼基因。系統進化分析表明：梨形環棱螺與福壽螺大約在2.88億年前產生分化；比較基因組分析表明：梨形環棱螺中有34個基因家族發生擴張，26個基因家族發生收縮，4個蛋白編碼的基因被正選擇（FDR<0.05）。該研究為進一步探究淡水螺類的生態學、進化及選擇育種提供了重要的基因組資源。

相關研究論文“Chromosome-level genome assembly of the freshwater snail Bellamya purificata （Caenogastropoda）”在線發表于JCR一區期刊《Zoological Research》（IF=6.975）上。淡水中心水產養殖研究室金武博士、華中農業大學水產學院曹小娟副教授為共同第一作者，徐東坡研究員和聞海波研究員為共同通訊作者。全文網址：https://www.zoores.ac.cn/en/article/doi/10.24272/j.issn.2095-8137.2022.118

本研究得到了水科院基本科研業務費（2021XT703）和淡水中心基本業務費（2021JBFM07）資助。

（院長江特色水生動物繁養創新團隊、水產養殖研究室、水生生物資源研究室 供稿）